Opći podaci o projektu
Naziv projekta: Razvoj digitalne i translacijske istraživačke platforme za istraživanje ishoda pneumonije kod steatotične bolesti jetre povezane s metaboličkom disfunkcijom
Naziv projekta na engleskom jeziku: Developing a Digital and Translational Research Platform for Pneumonia Outcomes in Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease
Akronim projekta: SteatoCAP
Voditelj projekta: doc. dr. sc. Neven Papić, dr. med.
Ustrojbena jedinica: Katedra za infektologiju, Sveučilište u Zagrebu Medicinski fakultet
Partneri na projektu: Klinika za infektivne bolesti „Dr. Fran Mihaljević”, Zagreb
Trajanje projekta: od 26. studenog 2025. do 26. studenog 2029. (48 mjeseci)
Ukupni iznos sredstava projekta: 159.999,24 €
Izvor financiranja: Nacionalni plan oporavka i otpornosti (NPOO); Institucionalni projekti (10106-25-2870)
Internetska stranica projekta: https://steatocap.eu/
Opis projekta
SteatoCAP istražuje kako steatotična bolest jetre povezana s metaboličkom disfunkcijom (MASLD) utječe na imunološki odgovor, težinu i ishode pneumonije iz opće populacije (engl. community-acquired pneumonia, CAP). Projekt polazi od pitanja zašto bolesnici sa sličnom infekcijom razvijaju različitu težinu i tijek bolesti te kakvu ulogu u tome imaju metaboličko zdravlje, jetra i crijevni mikrobiom. U prospektivnom istraživanju hospitaliziranih bolesnika povezuju se klinički podaci, procjena steatoze i tvrdoće jetre, imunološko profiliranje i analiza crijevne mikrobiote. Za analizu podataka koristit će se alati strojnog učenja kako bi se identificirali obrasci povezani s MASLD-om i nepovoljnim ishodima CAP-a. Uspostavom biobanke i standardizirane baze podataka projekt stvara temelj za daljnja translacijska istraživanja povezanosti metabolizma i infekcija.
Ciljevi projekta
Opći cilj: Glavni cilj projekta SteatoCAP je istražiti utjecaj MASLD-a na kliničke ishode pneumonije iz opće populacije uz digitalnu integraciju kliničkih podataka, imunološkog profiliranja i analize mikrobioma s ciljem boljeg razumijevanja imunometaboličkih mehanizama koji doprinose nepovoljnim ishodima bolesti.
Specifični ciljevi:
1. Ispitati povezanost MASLD-a s kliničkim ishodima pneumonije iz opće populacije
2. Usporediti imunološki odgovor tijekom CAP-a kod bolesnika s i bez MASLD-a, kroz longitudinalnu analizu citokinskog profila i fenotipa T-stanica
3. Analizirati promjene crijevnog mikrobioma tijekom pneumonije u bolesnika s i bez MASLD-a te identificirati mikrobne obrasce povezane s težinom bolesti i imunološkim disbalansom
4. Primijeniti metode strojnog učenja za integraciju kliničkih, imunoloških i mikrobiomskih podataka u cilju identifikacije prediktivnih obrazaca i razvoja kompetencija istraživačkog tima u analizi biomedicinskih podataka
5. Uspostaviti biobanku uzoraka s pridruženim detaljnim kliničkim, imunološkim i mikrobiomskim podatcima koja će omogućiti buduće multi-omics analize te poticati interdisciplinarnu suradnju izvan okvira trenutnog projekta
Metodologija projektnog istraživanja
Projekt je osmišljen kao prospektivno opservacijsko kohortno istraživanje koje će uključiti najmanje 350 odraslih bolesnika hospitaliziranih zbog pneumonije iz opće populacije. Unutar 48 sati od prijama provodit će se tranzijentna elastografija jetre radi procjene steatoze i tvrdoće jetre. Prikupljat će se antropometrijski, klinički, laboratorijski i mikrobiološki podaci te pratiti ishodi tijekom hospitalizacije i do 90. dana. U podkohorti od 120 bolesnika longitudinalno će se prikupljati uzorci krvi i stolice. Imunološke analize obuhvatit će mjerenje citokina i kemokina te fenotipizaciju T-limfocita multiparametrijskom protočnom citometrijom. Crijevna mikrobiota analizirat će se sekvenciranjem gena za 16S rRNA metodom sekvenciranja nove generacije, a dodatno će se određivati pokazatelji crijevne propusnosti. Uzorci će se pohranjivati u biobanku i povezivati s pseudonimiziranim podacima na digitalnoj platformi. Analize će uključivati multivarijabilne statističke modele, analizu ponovljenih mjerenja i metode strojnog učenja, uz procjenu prediktivne uspješnosti i internu validaciju modela.
Očekivani rezultati
- Procjena povezanosti MASLD-a i metaboličkih obilježja s težinom i ishodima izvanbolničke pneumonije.
- Prepoznavanje imunoloških i mikrobiomskih obrazaca povezanih s metaboličkim statusom i nepovoljnim tijekom bolesti.
- Razvoj i validacija modela procjene rizika koji objedinjuju kliničke i biološke pokazatelje.
- Uspostavljena digitalna istraživačka platforma i biobanka s longitudinalno prikupljenim uzorcima i pridruženim kliničkim podacima.
- Znanstvene publikacije, kongresna priopćenja i edukacijski sadržaji te jačanje kompetencija mladih istraživača u translacijskoj medicini i analizi biomedicinskih podataka.
Projektni tim
Popis osoba projektnog tima s Medicinskog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu
1. doc. dr. sc. Neven Papić
2. dr. sc. Juraj Krznarić
3. dr. med. Branimir Gjurašin
Popis osoba projektnog tima partnera
1. prof. dr. sc. Arjana Tambić Andrašević (Stomatološki fakultet, pročelnica Zavoda za kliničku mikrobiologiju KZIB)
2. izv. prof. dr. sc. prim. Klaudija Višković (Fakultet Zdravstvenih studija, pročelnica Zavoda za radiološku i ultrazvučnu dijagnostiku, KZIB)
3. izv. prof. dr. sc. Snježana Židovec Lepej, mag. biol. mol. (Prirodoslovno-matematički fakultet – Biološki odsjek; KZIB, pročelnica Odjela za imunološku i molekularnu dijagnostiku)
4. dr. sc. Lidija Cvetko Krajinović, mag. biol. mol. (KZIB, voditeljica Odjela za translacijsku medicinu i imunologiju)
5. dr. sc. Željka Mačak Šafranko, mag. biol. mol. (KZIB, Odjel za translacijsku medicinu i imunologiju)
6. dr. sc. Leona Radmanić Matotek, mag. biol. mol. (KZIB, Odjel za imunološku i molekularnu dijagnostiku)
7. Josip Ujević, mag. biol. mol. (KZIB, Zavod za kliničku mikrobiologiju)
8. dr. sc. Marko Jelić, mag. biol. mol. (KZIB, Zavod za kliničku mikrobiologiju)
9. dr. med. Armin Mehmedović (KZIB, Zavod za radiološku i ultrazvučnu dijagnostiku)
10. Kristian Bodulić, mag. biol. mol. (KZIB, voditelj Odjela za bioinformatiku i statistiku) 11. Mag. educ. biol. et chem. Magdalena Sikora, (KZIB, voditeljica Odjela za međunarodnu suradnju)
Diseminacija i vidljivost projekta
Projekt ima dvojezičnu mrežnu stranicu https://steatocap.eu/, na kojoj se objavljuju ciljevi istraživanja, sastav tima, napredak projekta i aktualnosti. Za vrijeme trajanja projekta planirani su objavljivanje rezultata u recenziranim znanstvenim časopisima, izlaganja na domaćim i međunarodnim kongresima te radionice za kliničare, istraživače i studente. Aktivnosti za širu javnost bit će usmjerene na razumijevanje povezanosti metaboličkog zdravlja i infekcija. Podaci o održanim događajima i objavljenim radovima redovito će se dopunjavati.
Mini simpozij i predstavljanje projekta